农业公司主要涉及的税种包括：
增值税
一般纳税人适用税率17%，可以抵扣进项税额；小规模纳税人适用税率3%。
农业生产者销售的自产农产品通常免征增值税。
购进农产品再销售，一般纳税人适用9%的税率，小规模纳税人适用3%的征收率。
企业所得税
从事种植业、养殖业等项目的所得，可以免征或减半征收企业所得税。
重点龙头企业、国有农口企事业单位、国有企事业单位等从事特定业务取得的所得暂免征收企业所得税。
个人所得税
农业企业支付的工资薪金等个人所得，需要按照规定代扣代缴个人所得税。
印花税
实收资本需要缴纳印花税。
公司之间的买卖合同需要缴纳印花税。
耕地占用税
农业公司如果占用了耕地，需要缴纳耕地占用税。
房产税
农业企业拥有的房产可能需要缴纳房产税，但用于农产品加工的生产经营用房可能会有减免政策。
土地使用税
在城市、县城、建制镇、工矿区范围内使用土地的农业企业，需要按照实际占用的土地面积缴纳土地使用税。
其他税种
城市维护建设税、教育费附加、地方教育费附加等。
营业税（已取消）。
契税（已取消）。
建议农业公司在日常经营中，合理规划税务事宜，充分利用税收优惠政策，以降低税负。同时，要关注税收政策的变化，及时调整财务和税务策略。
