开具增值运输发票的步骤如下：
使用开票软件
在开票软件中，首先在客户编码族里输入要开票的客户信息，在商品编码族里输入运输点并保存。
进入开具增值税专用发票界面，选择已输入的信息，填写运输费金额，并选择适用的税率（如9%）。
在发票的备注栏中，需要填写运输费的起始地、目的地、车牌号以及运输的货物名称等信息。
税务局代开
可以选择到税务局代开增值税专用发票或货物运输业增值税专用发票。
代开增值税专用发票需要提供《代开增值税专用发票缴纳税款申报单》、税务登记证副本等资料。
代开货物运输业增值税专用发票除了上述资料外，还需提供承运人同货主签订的承运货物合同或托运单、完工单等有效证明，以及车辆、船舶及其营运资质的有效证明复印件。
若要代开普通发票，则需提供《代开发票申请表》、税务登记证副本、身份证明原件及复印件等资料。
合并开具与分开开具
如果需要将货物金额和运输金额合并开具在一张发票上，需要在合同中注明包含运费，并分别注明货物金额和运输金额。
如果原先没有协议好承包运费，货物发票已经提前开好了，运输费发票需要单独开，并且作为非运输企业不能开具增值税运输费发票。
发票开具的注意事项
发票项目填写必须齐全，全部联次一次填开，确保上、下联的内容和金额一致。
发票字迹要清楚，不得涂改。如有填写错误，应另行开具专用发票，并在误填的专用发票上注明“误填作废”。
发票联和抵扣联需加盖财务专用章或发票专用章。
增值税发票的抵扣
取得用于进项抵扣的运输发票时，应当填写《增值税运输发票抵扣清单》，并在进行增值税纳税申报时一并报送。
请根据以上步骤和注意事项开具增值运输发票，确保合规性和准确性。
